Bilbao Zerbitzuak está organizado en 3 áreas, según el tipo de servicios que presta.

• Servicios Generales
• Cementerios
• Mercados

Cada área tiene capacidad para planificar, organizar y gestionar sus recursos humanos y técnicos.

Las áreas desarrollan sus funciones bajo la dirección política de la Presidencia y la dirección ejecutiva de la Gerencia.

Bilbao Zerbitzuak no participa en otras entidades ni dispone de ningún órgano adscrito sin personalidad jurídica diferenciada.